Xem mã nguồn của Enzyme phiên mã ngược

[[Tập tin:Vi.Phiên mã ngược reverse transcription.png|nhỏ|Hình 1: Phiên mã (DNA - RNA) và phiên mã ngược (RNA - DNA).]]
* '''Phiên mã ngược''' là quá trình tổng hợp chuỗi đơn DNA từ khuôn mẫu RNA thông tin.<ref>Campbell và cộng sự: "Sinh  học" - Nhà xuất bản Giáo dục, 2010.</ref><sup>,</sup> <ref>{{Chú thích web|url=https://www.projectinform.org/glossary/retrotranscription/|title=Retrotranscription.|last=|first=|date=|website=|archive-url=https://web.archive.org/web/20181205104901/https://www.projectinform.org/glossary/retrotranscription/|archive-date = ngày 5 tháng 12 năm 2018 |url-status=|access-date=}}</ref><sup>,</sup> <ref>{{Chú thích web|url=https://www.neb.com/applications/cloning-and-synthetic-biology/dna-preparation/reverse-transcription-cdna-synthesis|title=Reverse Transcription (cDNA Synthesis).|last=|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref>
* Quá trình phiên mã ngược nói trên chỉ thực hiện được nhờ một loại enzyme đặc trưng gọi là enzyme phiên mã ngược.
*Trong hình 1:
**Quá trình mà DNA tạo ra RNA gọi là [[phiên mã]], được xúc tác bởi enzyme phiên mã '''RNA polymerase'''.
**Còn quá trình ngược lại mà RNA tạo ra DNA gọi là phiên mã ngược, được xúc tác bởi '''enzyme phiên mã ngược''' (reverse transcriptase, viết tắt: '''RT''').
* Bởi vì quá trình này tổng hợp nên DNA, nên enzyme này có chức năng tương tự enzyme DNA-polymeraza trong nhân đôi DNA bình thường; nhưng nó lại dựa vào khuôn mẫu là RNA, nên tên đầy đủ của nó trong các giáo trình Sinh hoá học hoặc Di truyền học phân tử gọi là DNA-polymerase phụ thuộc RNA ('''RNA-dependent DNA polymerase''') hoặc DNA-polymerase tạo bởi RNA ('''RNA-directed DNA polymerase''').<ref name=":0" />

==Nguồn gốc thuật ngữ==
* Trong lịch sử phát triển của [[Sinh học phân tử]], một trong những nhà khoa học đầu tiên nêu ra vai trò quyết định của DNA trong quá trình di truyền   là [[Francis Crick]]. Theo ông - trái ngược hẳn với quan niệm trước đó cho rằng vai trò trung tâm của tính di truyền là protein - thì DNA có vai trò trung tâm: DNA tổng hợp ra RNA, rồi - đến lượt nó - RNA tạo ra protein, từ đó biểu hiện thành tính trạng. Điều này được tóm tắt bằng sơ đồ nổi tiếng: '''DNA <math>\longrightarrow</math>RNA <math>\longrightarrow</math>Protein'''.<ref>SGK "Sinh học 12" - Nhà xuất bản Giáo dục, 2017.</ref> Tư tưởng này đã phản ánh trong [[Luận thuyết trung tâm]] của ông.
*Quá trình "DNA <math>\longrightarrow</math>RNA" ở sơ đồ trên chính là quá trình [[phiên mã]]. Tuy nhiên, do sự phát triển mạnh mẽ của khoa học và công nghệ, người ta đã phát hiện ra rằng: trong cơ thể sinh vật, RNA lại có khả năng tổng hợp ra DNA, ngược lại sơ đồ trên, nghĩa là: RNA <math>\longrightarrow</math>DNA và quá trình này gọi là '''phiên mã ngược'''.
*Khái niệm phiên mã ngược được dịch từ thuật ngữ tiếng Anh:  "'''retrotranscription'''" hoặc "reverse transcription", cũng còn được dịch là "sao chép ngược" hoặc "sao mã ngược", dùng để chỉ quá trình mà [[RNA thông tin]] được làm khuôn để tạo ra âm bản DNA giống như bản khuôn đã tổng hợp ra nó.  Dạng âm bản DNA này là một mạch đơn, bổ sung với mẫu RNA, nên gọi là DNA bổ sung (complementary DNA, viết tắt là '''cDNA'''). Xem chi tiết hơn về dạng này ở trang [[DNA bổ sung]].<ref>{{Chú thích web|url=https://www.sciencedirect.com/topics/neuroscience/complementary-dna|title=cDNA.|last=Y. Kohara|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref>
*Quá trình tạo ra [[DNA bổ sung]] này bắt buộc phải có loại enzyme phiên mã ngược - thuật ngữ tiếng Anh: '''retrotranscriptase'''.<ref>{{Chú thích web|url=http://biotools.eu/en/cdna/347-10077-4116-Biotools-High-Retrotranscriptase.html|title=Retrotranscriptase|last=|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref> Đây là một nhóm prôtêin có khả năng xúc tác quá trình phiên mã ngược, cũng thường được gọi là '''reverse transcriptase''', hay ngắn gọn hơn là revertaza.<ref name=":0">{{Chú thích web|url=https://www.britannica.com/science/reverse-transcriptase|title=Reverse transcriptase.|last=|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref>

== Lược sử phát hiện ==
{{Infobox protein family
| Symbol = RVT_1
| Name =DNA-pôlymêraza phụ thuộc RNA.
| image = Reverse transcriptase 3KLF labels.png
| width =
| caption =  Hình 2: Mô hình tinh thể enzym phiên mã ngược của một chủng [[HIV]].<ref name="pmid20852643">{{PDB|3KLF}}; {{chú thích tạp chí | author = Tu X, Das K, Han Q, Bauman JD, Clark AD Jr, Hou X, Frenkel YV, Gaffney BL, Jones RA, Boyer PL, Hughes SH, Sarafianos SG, Arnold E | title =Structural basis of HIV-1 resistance to AZT by excision. | journal = Nat. Struct. Mol. Biol. | volume = 17 | issue = 10 | pages = 1202–9 |date=September 2010 | pmid = 20852643 | pmc = 2987654 | doi = 10.1038/nsmb.1908 | url =  }}</ref>
| Pfam = PF00078
| Pfam_clan = CL0027
| InterPro = IPR000477
| SMART =
| PROSITE = PS50878
| SCOP = 1hmv
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd00304
| PDB = {{PDB2|1bqm}}, {{PDB2|1bqn}}, {{PDB2|1c0t}}, {{PDB2|1c0u}}, {{PDB2|1c1b}}, {{PDB2|1c1c}}, {{PDB2|1d0e}}, {{PDB2|1d1u}}, {{PDB2|1dlo}}, {{PDB2|1dtq}}, {{PDB2|1dtt}}, {{PDB2|1eet}}, {{PDB2|1ep4}}, {{PDB2|1fk9}}, {{PDB2|1fko}}, {{PDB2|1fkp}}, {{PDB2|1har}}, {{PDB2|1hmv}}, {{PDB2|1hni}}, {{PDB2|1hnv}}, {{PDB2|1hpz}}, {{PDB2|1hqe}}, {{PDB2|1hqu}}, {{PDB2|1hvu}}, {{PDB2|1hys}}, {{PDB2|1i6j}}, {{PDB2|1ikv}}, {{PDB2|1ikw}}, {{PDB2|1ikx}}, {{PDB2|1iky}}, {{PDB2|1j5o}}, {{PDB2|1jkh}}, {{PDB2|1jla}}, {{PDB2|1jlb}}, {{PDB2|1jlc}}, {{PDB2|1jle}}, {{PDB2|1jlf}}, {{PDB2|1jlg}}, {{PDB2|1jlq}}, {{PDB2|1klm}}, {{PDB2|1lw0}}, {{PDB2|1lw2}}, {{PDB2|1lwc}}, {{PDB2|1lwe}}, {{PDB2|1lwf}}, {{PDB2|1mml}}, {{PDB2|1mu2}}, {{PDB2|1n4l}}, {{PDB2|1n5y}}, {{PDB2|1n6q}}, {{PDB2|1nnd}}, {{PDB2|1qai}}, {{PDB2|1qaj}}, {{PDB2|1qe1}}, {{PDB2|1r0a}}, {{PDB2|1rev}}, {{PDB2|1rt1}}, {{PDB2|1rt2}}, {{PDB2|1rt3}}, {{PDB2|1rt4}}, {{PDB2|1rt5}}, {{PDB2|1rt6}}, {{PDB2|1rt7}}, {{PDB2|1rtd}}, {{PDB2|1rth}}, {{PDB2|1rti}}, {{PDB2|1rtj}}, {{PDB2|1rw3}}, {{PDB2|1s1t}}, {{PDB2|1s1u}}, {{PDB2|1s1v}}, {{PDB2|1s1w}}, {{PDB2|1s1x}}, {{PDB2|1s6p}}, {{PDB2|1s6q}}, {{PDB2|1s9e}}, {{PDB2|1s9g}}, {{PDB2|1suq}}, {{PDB2|1sv5}}, {{PDB2|1t03}}, {{PDB2|1t05}}, {{PDB2|1tkt}}, {{PDB2|1tkx}}, {{PDB2|1tkz}}, {{PDB2|1tl1}}, {{PDB2|1tl3}}, {{PDB2|1tv6}}, {{PDB2|1tvr}}, {{PDB2|1uwb}}, {{PDB2|1vrt}}, {{PDB2|1vru}}, {{PDB2|1ztt}}, {{PDB2|1ztw}}, {{PDB2|2b5j}}, {{PDB2|2b6a}}, {{PDB2|2ban}}, {{PDB2|2be2}}, {{PDB2|2fjv}}, {{PDB2|2fjw}}, {{PDB2|2fjx}}, {{PDB2|2fvp}}, {{PDB2|2fvq}}, {{PDB2|2fvr}}, {{PDB2|2fvs}}, {{PDB2|2hmi}}, {{PDB2|2hnd}}, {{PDB2|2hny}}, {{PDB2|2hnz}}, {{PDB2|2i5j}}, {{PDB2|2iaj}}, {{PDB2|2ic3}}, {{PDB2|2opp}}, {{PDB2|2opq}}, {{PDB2|2opr}}, {{PDB2|2ops}}, {{PDB2|2r2r}}, {{PDB2|2r2s}}, {{PDB2|2r2t}}, {{PDB2|2r2u}}, {{PDB2|2rf2}}, {{PDB2|2rki}}, {{PDB2|2vg5}}, {{PDB2|2vg6}}, {{PDB2|2vg7}}, {{PDB2|2zd1}}, {{PDB2|2ze2}}, {{PDB2|3bgr}}, {{PDB2|3c6t}}, {{PDB2|3c6u}}, {{PDB2|3di6}}, {{PDB2|3dle}}, {{PDB2|3dlg}}, {{PDB2|3dlk}}, {{PDB2|3dm2}}, {{PDB2|3dok}}, {{PDB2|3dol}}, {{PDB2|3drp}}, {{PDB2|3drr}}, {{PDB2|3drs}}, {{PDB2|3hvt}}
}}

*Hiện tượng phiên mã ngược được phát hiện bởi [[Howard Temin]] tại [[Đại học Wisconsin-Madison]], và được phát hiện một cách độc lập bởi [[David Baltimore]] vào năm 1970 tại [[Học viện Công nghệ Massachusetts|MIT]]<ref>{{chú thích DOI|10.1038/2261209a0}}</ref><ref>{{chú thích DOI|10.1038/2261211a0}}</ref>. Cả hai cùng đoạt một giải Nobel năm 1975 [[danh sách người đoạt giải Nobel Sinh lý học và Y khoa|giải Nobel Sinh lý và Y khoa]] chia sẻ cùng với [[Renato Dulbecco]] cho thành tựu của cả ba người.
* Khám phá này ban đầu tỏ ra mâu thuẫn với "giáo điều" của [[Luận thuyết trung tâm]] trong [[sinh học phân tử]] do Francis Crick đề xuất, theo đó: DNA được phiên mã thành [[RNA]] rồi mới tổng hợp nên [[protein]]. Tuy nhiên, khả năng mà thông tin di truyền có thể "chuyển ngược" theo cách này cuối cùng đã được giới khoa học chấp thuận.<ref>{{chú thích DOI|10.1038/2261198a0}}</ref>.
*Đến đầu những năm 1980, virut sao ngược (retrovirus) gây ra bệnh bạch cầu ở người gọi là HTLV-I và HTLV-II được phát hiện. Năm 1983, người ta đã tách lập được [[HIV]] và xác định nó là tác nhân gây bệnh AIDS. HIV lây nhiễm các tế bào bạch cầu thuộc dòng tế bào hỗ trợ T, chúng nhân lên nhanh chóng, sinh sôi nảy nở làm hàng loạt tế bào T chết, phá hủy hệ miễn dịch. Trong năm 2007, khoảng 2,1 triệu người trên toàn thế giới đã chết do AIDS, ước tính có 33,2 triệu người sống chung với HIV, và khoảng 2,5 triệu người mới nhiễm HIV.
* Ngày nay, loại enzyme này đã được nghiên cứu kỹ lưỡng (hình 2) và có nhiều ứng dụng quan trong trong công nghệ sinh học phân tử cũng như trong y học. Các loại thuốc ức chế enzyme sao chép ngược là phương pháp điều trị đầu tiên cho những người đang phơi nhiễm HIV. Chất ức chế đầu tiên thuộc loại này là enzyme sao ngược [[nucleoside|nentori]] NTR như AZT (zidovudine) - thuốc đầu tiên được Cơ quan quản lý thực phẩm và dược phẩm Hoa Kỳ phê duyệt để kéo dài tuổi thọ của bệnh nhân AIDS, có tác dụng phá huỷ chuỗi DNA tiền virut (proviral DNA) trước khi enzyme kết thúc phiên mã. Các NTR còn được kết hợp với các thuốc ức chế enzyme sao chép ngược '''không''' [[nucleoside|nentori]] (NTR) như efavirenz, hoạt động bằng cách liên kết và thay đổi hình dạng của enzyme, nên nó coi như bị mất chức năng.
*Như vậy, enzyme phiên mã ngược vốn được phát hiện là loại enzyme có nguồn gốc từ vật liệu di truyền của virut sao ngược xúc tác sự phiên mã của RNA ở virut (axit ribônuclêic) thành DNA (axit đêôxyribônuclêic). Sự xúc tác phiên mã này là quá trình  ngược lại của phiên mã tế bào bình thường mà DNA tạo ra RNA, do đó các tên này là sao ngược và "retrovirus" gọi là virut sao ngược. RT chính là bản chất lây nhiễm của virut sao ngược (retrovirus), một số trong số đó gây bệnh ở người, bao gồm virus suy giảm miễn dịch ở người (HIV) gây hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải (AIDS) và virut lymphô ở tế bào T của người I (HTLV-I) gây bệnh bạch cầu. Những bệnh hoặc hội chứng này không di truyền.
*Tuy nhiên, gần đây người ta đã phát hiện các chủng retrovirus có khả năng "chèn" gen của nó vào [[tế bào mầm]], do đó gen này hoàn toàn có khả năng nằm trong bộ gen của giao tử (trứng,  tinh trùng) do đó sẽ di truyền cho thế hệ sau.<ref>{{Chú thích web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC138943/|title=Endogenous retroviruses in the human genome sequence.|last=David J Griffiths|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref> (Xem thêm mục ERV ở trang [[Nhân tố chuyển vị ngược LTR|Nhân tố chuyển vị ngược LTR).]]
*Ngoài ra, enzyme phiên mã ngược cũng là một thành phần cơ bản của công nghệ phòng thí nghiệm được gọi là phản ứng chuỗi sao chép ngược polymerase (RT-PCR), một công cụ mạnh được sử dụng trong nghiên cứu và chẩn đoán các bệnh như ung thư.<ref>{{Chú thích web|url=https://www.britannica.com/science/reverse-transcriptase|title=Reverse transcriptase.|last=Douglas Morier|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref>

== Cơ chế hoạt động ==
[[Tập tin:Hiv gross german.png|nhỏ|Hình 3: HIV nhiễm vào tế bào của người.]]

=== Ở virus ===
Nói chung, RT (enzyme phiên mã ngược) trước hết phải có một khuôn mẫu là RNA tương thích với nó.

* Chẳng hạn như HIV có bộ "gene" gồm hai phân tử RNA (hình S ngược sẫm màu trong sơ đồ phải của  hình 3), đồng thời tự nhiên cũng phú cho nó sẵn có hai RT riêng tương thích kèm theo. Do đó, khi nhiễm vào người, RT tạo ra mạch đơn DNA bổ sung (cDNA) theo mẫu riêng của nó, mặc dù nó lấy tất cả nguyên, vật liệu của người.
* Tiếp theo, cDNA này biến đổi thành DNA hai mạch xoắn kép, nhờ bộ máy nhân đôi và nguyên, vật liệu của người.
* Cuối cùng DNA mạch kép này "hoành hành" trong tế bào chủ của người là tế bào T (sơ đồ bên trái của  hình 3).

Sơ đồ mô tả chi tiết hơn ở hình 4.

=== Ở nhân thực ===
[[Tập tin:Reverse transcription.svg|nhỏ|Hình 3: Sơ đồ mô tả hoạt động RT của virut.]]
Sau khám phá vạch thời đại của bà [[Barbara McClintock]], người ta đã phát hiện ra rằng phiên mã ngược không chỉ  có ở virut và do virut gây ra, mà còn tồn tại một cách tự nhiên ở trong bộ gen của sinh vật nhân thực, trong đó có người. Hệ RT này góp phần quan trọng để tạo ra quá trình chuyển vị ngược gây [[tái tổ hợp không tương đồng]], giúp sinh vật phong phú và đa dạng hơn. Xem chi tiết chuyên đề này ở trang [[Nhân tố chuyển vị ngược]] (retrotransposons).

Ngay cả quá trình hình thành cấu trúc cực kỳ quan trọng ở người cũng như rất nhiều loài sinh vật khác, gọi là cấu trúc đầu mút NST hay [[telomere]], cũng cần có RT riêng gọi là [[telomerase]].<ref>{{Chú thích web|url=https://learn.genetics.utah.edu/content/basics/telomeres/|title=Are Telomeres the Key to Aging and Cancer.|last=|first=|date=|website=|archive-url=|archive-date=|url-status=|access-date=}}</ref>

Cơ chế hoạt động của các RT trong những trường hợp trên là rất phức tạp, không trình bày ở chuyên khảo này. Có thể tham khảo ở các trang [[Nhân tố chuyển vị ngược LTR]], [[Gen nhảy]] v.v.
== Nguồn trích dẫn ==
{{tham khảo|30em}}

[[Thể loại:Sinh học]]
[[Thể loại:Di truyền học]]
[[Thể loại:Sinh học phân tử]]
[[Thể loại:Enzyme virus]]