Xem mã nguồn của Pyridoxine 5'-phosphate synthase

{{enzyme|Name=Pyridoxine 5'-phosphate synthase|EC_number=2.6.99.2|CAS_number=|IUBMB_EC_number=2/6/99/2|GO_code=|image=|width=|caption=}} Trong [[enzym|enzyme học]], '''pyridoxine 5'-phosphate synthase''' ({{EC number|2.6.99.2}}) là [[enzym]]e [[xúc tác]] cho [[phản ứng hóa học]]

: 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate + 3-hydroxy-1-aminoacetone phosphate <math>\rightleftharpoons</math> pyridoxine-5'-phosphate + phosphate + 2 H<sub>2</sub>O

Hai cơ chất của enzyme này là [[1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate]] (DXP) và [[3-hydroxy-1-aminoacetone phosphate]] (HAP), 3 sản phẩm là [[Nước|H<sub>2</sub>O]], [[phosphat]]e và pyridoxine-5'- phosphate (một vitamer của [[Phosphidoxit phốt phát|pyridoxal phosphate]]).

== Cấu trúc ==
Trong điều kiện sinh học, pridoxine-5'-phosphate synthase, hay pdxJ, có cấu trúc như một [[Oligomer|octamer]].<ref name="Garrido-Franco2003">{{Chú thích tạp chí|vauthors=Garrido-Franco M|date=April 2003|title=Pyridoxine 5'-phosphate synthase: de novo synthesis of vitamin B6 and beyond|journal=Biochimica et Biophysica Acta|volume=1647|issue=1–2|pages=92–7|doi=10.1016/s1570-9639(03)00065-7|pmid=12686115}}</ref><ref>{{Chú thích tạp chí|vauthors=Garrido-Franco M, Huber R, Schmidt FS, et al|date=2000|title=Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of PdxJ, the pyridoxine 50-phosphate synthesizing enzyme|journal=Acta Crystallographica|volume=56|issue=8|pages=1045&ndash;48|doi=10.1107/S0907444900007368}}</ref> Octamer này có thể được coi là tetramer được dimer hóa. Trong mỗi dimer, dư lượng [[arginine]] Arg20 tạo thành một phần của vị trí hoạt động trong monome khác, nơi liên kết cả hai nhóm [[phosphat]]e.<ref name="Garrido-Franco2001">{{Chú thích tạp chí|vauthors=Franco MG, Laber B, Huber R, Clausen T|date=March 2001|title=Structural basis for the function of pyridoxine 5'-phosphate synthase|journal=Structure|volume=9|issue=3|pages=245–53|doi=10.1016/S0969-2126(01)00584-6|pmid=11286891}}</ref>

== Phân loại ==
Enzyme này thuộc họ [[Chuyển|transferase]], thuộc nhóm chuyển đổi nhóm chứa nitơ này sang nhóm chứa nitơ khác.

== Danh pháp ==
Tên hệ thống của lớp enzyme này là '''1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate: 3-amino-2-oxopropyl phosphate 3-amino-2-oxopropyltransferase (phosph-hydrolysing; cyclizing)'''. Các tên khác được sử dụng phổ biến bao gồm '''pyridoxine 5-phosphate phospho lyase''', '''PNP synthase''' và '''PdxJ'''.

== Vai trò sinh học ==
Enzyme này tham gia vào [[Vitamin B6|quá trình chuyển hóa vitamin B<sub>6</sub>]]. pdxJ đóng vai trò trong [[Vitamin B6|con đường phụ thuộc DXP]] của pyridoxal phosphate. Con đường phụ thuộc DXP được tìm thấy chủ yếu ở [[proteobacteria dạng γ]] và một số vi khuẩn [[proteobacteria dạng α]].<ref name="Mittenhuber20013">{{chú thích tạp chí|vauthors=Mittenhuber G|title=Phylogenetic analyses and comparative genomics of vitamin B6 (pyridoxine) and pyridoxal phosphate biosynthesis pathways|journal=Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology|volume=3|issue=1|pages=1–20|date=January 2001|pmid=11200221}}</ref> Do sự phân phối này, pdxJ là một  mục tiêu tiềm năng để làm [[kháng sinh]].<ref name="Mittenhuber20013"/><ref>{{Chú thích tạp chí|vauthors=Ahmad S, Raza S, et al|date=2018|title=From phylogeny to protein dynamics: A computational hierarchical quest for potent drug identification against an emerging enteropathogen "Yersinia enterocolitica".|journal=Journal of Molecular Liquids|volume=265|pages=372&ndash;89|doi=10.1016/j.molliq.2018.06.013}}</ref> Tuy nhiên, phương pháp này bị giới hạn vì pdxJ không được tìm thấy trong ký sinh trùng bắt buộc.  Chuyển hóa vitamin B <sub>6</sub> trong microbiome cũng đã được chứng minh là làm thay đổi tác dụng của một số hợp chất trên vật chủ.<ref>{{Chú thích tạp chí|display-authors=6|vauthors=Scott TA, Quintaneiro LM, Norvaisas P, Lui PP, Wilson MP, Leung KY, Herrera-Dominguez L, Sudiwala S, Pessia A, Clayton PT, Bryson K, Velagapudi V, Mills PB, Typas A, Greene ND, Cabreiro F|date=April 2017|title=Host-Microbe Co-metabolism Dictates Cancer Drug Efficacy in C. elegans|journal=Cell|volume=169|issue=3|pages=442–456.e18|doi=10.1016/j.cell.2017.03.040|pmc=5406385|pmid=28431245}}</ref>

== Tham khảo ==
{{Tham khảo|30em}}